http://www.physorg.com/news130482583.html
May 20, 2008
美國研究者藉由在基因上修改細菌，創造出「活生生的電腦（living computers）」。此研究的發現，發表在 BioMed Central 開放存取的 Journal of Biological Engineering 上，證明了在活細胞中進行運算是可行的，同時開啟了一些應用的大門，包括資料儲存，以及作為一種遺傳工程的工具用以操縱基因。
一個來自於北卡羅來納州 Davidson College 生物與數學系以及密蘇里州 Missouri Western 州立大學的科學家團隊，將基因添加到大腸桿菌（E. coli）中，創造出細菌電腦，能解開古典的數學難題，稱為燒焦的薄煎餅問題（burnt pancake problem，譯註：即 Pancake sorting，這問題與比爾蓋茲有些關係，參見：http://weco.net/blog/ie945232/13-jun-2007/2070，http://en.wikipedia.org/wiki/Pancake_sorting）
這個燒焦薄煎餅問題涉及到一疊大小不同的薄煎餅，每個都有各有金黃色與燒焦的一面。目標是要將這一疊薄煎餅排序，讓最大的薄煎餅在最底下，而且所有的薄煎餅都是金黃色那一面朝上。每次翻轉都會使一個或數個連續不斷之薄煎餅的順序以及方向（換言之，薄煎餅的哪一面朝上）顛倒。目標是要在最少翻轉次數下將它們疊成正確的一堆。
在這項實驗中，研究者把 DNA 片段當成薄煎餅使用。他們添加來自於不同類型細菌的基因，讓大腸桿菌能夠翻轉 DNA「薄煎餅」。他們亦包含一種基因，使細菌能抵抗抗生素，但只有當 DNA 片段已翻轉至正確次序時才會生效。細菌達到數學上的解所需要的時間，反映出解開燒焦薄煎餅問題所需之最小翻轉次數。
"這個系統提供了數種潛在優勢超越了傳統電腦，" 領導研究者 Karmella Haynes 說。"一只燒瓶可容納數十億隻細菌，每一個都有可能包含數份用來運算的 DNA 拷貝。這些「細菌電腦」能相互平行運作，這表示會比傳統電腦更快獲得解答。同時使用較少的空間與較低的成本。" 除了平行之外，細菌運算也有潛力利用修復機制，當然，也能推斷出之後的重複使用。
※ 這篇是第 1000 篇 :) 相關報導：
＊ Engineering bacteria to solve the Burnt Pancake Problem
http://www.jbioleng.org/content/2/1/8/abstract
Karmella A Haynes, Marian L Broderick, Adam D Brown,＊ 等公車或走路 數學家：懶是上策
Trevor L Butner, James O Dickson, Lance Harden, Lane H Heard,
Eric L Jessen, Kelly J Malloy, Brad J Ogden, Sabriya Rosemond,
Samantha Simpson, Erin Zwack, Malcolm Campbell, Todd T Eckdahl,
Laurie J Heyer and Jeffrey L Poet
Journal of Biological Engineering 2008, 2:8, 20 May 2008
doi:10.1186/1754-1611-2-8
＊ 雪花的數學模型
＊ 尋找網路的演算法 -- 用於基因或網際網路
＊ 基因的「選擇特徵」協助偵測細菌的天擇
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