MIT 分子探針能協助了解細胞的發訊路徑

MIT probe may help untangle cells' signaling pathways
http://www.physorg.com/news133783885.html

June 27, 2008

MIT 研究者設計一種新類型的探針，那能夠在一個活細胞中呈現出數以千計蛋白質之間的互動，賦予他們一種工具來解開糾結的發訊路徑網絡，那控制絕大部份的細胞活動。

"我們能使用這個來確認新蛋白夥伴或著描繪現存交互作用的特徵。我們能確認這些蛋白涉及了哪些發訊路徑，以及交互作用在細胞週期的哪一個階段發生，" Alice Ting 說，Pfizer-Laubach 生涯發展化學助教授，同時也是發表於 7/27 當期 Journal of the American Chemical Society 上的、一篇描述這種探針的論文的資深作者。

這項新技術讓研究者能以探針標記蛋白，若蛋白在細胞內互動，探針就如同拼圖般連在一起。這些探針源自於一種酵素與其胜肽（peptide）基質。如果連結探針的蛋白起交互作用，此酵素與基質也會跟著互動，那很容易就能偵測到。

為了要創造此探針，研究者使用了生物素連接酶（biotin ligase）這種酵素及其目標，一種由 12 個胺基酸所組成的胜肽。

他們研究在概念上與一種方式相關，那把 GFPs（綠螢光蛋白），那會在活化時發光，當成探針使用。每個 GFP 分子的一半附加在感興趣的蛋白上，當蛋白互動時，一半的 GFP 融合（fuse）並發光。然而，這種技術導致許多假陽性，因為一半的 GFP 會互相尋找並結合，即便它們所附加的蛋白質並沒有互動，Ting 說。

這種新探針能用來研究近乎所有蛋白與蛋白間的互動，Ting 說。研究者在二個涉及抑制免疫系統的蛋白，以及二種在細胞分裂中扮演角色的蛋白上測試他們的探針。他們目前正使用這種探針來呈現涉及活神經元中突觸生長的的蛋白質交互作用。

※ 相關報導：

＊ Protein-Protein Interaction Detection in Vitro and in Cells by Proximity Biotinylation
http://pubs.acs.org/cgi-bin/abstract.cgi/jacsat/asap/abs/ja801445p.html

Marta Fernandez-Suaarez, T. Scott Chen, and Alice Y. Ting
ASAP J. Am. Chem. Soc., ASAP Article, June 27, 2008
doi: 10.1021/ja801445p

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