Only Perception: 癌症基因圖譜首度完整解碼

2008-11-08

癌症基因圖譜首度完整解碼

編譯陳成良／綜合報導 2008-11-07 自由時報

美國聖路易的華盛頓大學醫學院的科學家首度成功將一名癌症病患的完整基因組解碼，並找出一組可能致癌或使癌症惡化的基因；這項研究提供了瞭解癌症基因基礎結構的新方法，並有助發展出更好的癌症治療方式。

這項研究結果發表在6日出刊的最新一期「自然」科學期刊上。

定序的基因組來自於一名五十多歲婦女，她被診斷出罹患急性骨髓性白血病（AML）23個月後死亡。

根據統計顯示，每5名被診斷出罹患AML的病患中，只有一人能活超過五年。

研究人員試圖找到可能引發AML的基因突變，他們將取自患者骨髓的腫瘤基因組與其正常基因組，利用「高流量定序」（high throughput sequencing）技術分別完成定序，然後加以比較，結果找出10個顯然與誘發AML有關的突變基因。先前的研究只發現到其中兩個，其餘8個之前從未被認為與AML有關。

研究人員指出，這8個基因中，有3個通常的作用是抑制腫瘤生長，另外3個與促進細胞生長有關，最後一個則可能影響到藥物進入細胞的方式。該基因定序費時僅數月，花費百萬美元。

主持這項研究的雷伊博士說：「這是人類惡性腫瘤的基因組首度被定序，過去我們通常只能從一部分的基因組中尋找突變，但這是我們首度能夠檢視完整的基因組。」

研究人員指出，隨著DNA定序科技的速度更快、費用更低，醫學界已可更深入瞭解癌症基因，為發展出更有效的癌症診斷及治療方式，奠下基礎。他們也期望，在5到20年內，醫學能進步到只要抽取癌症病人的一滴血，放上晶片送入電腦進行比對，就能馬上找出治療病人最有效的藥物。

※ 相關報導：

＊ Cancer patient genome sequenced for the first time
http://www.physorg.com/news145110310.html

＊ DNA sequencing of a cytogenetically normal acute myeloid leukaemia genome
http://www.nature.com/nature/journal/v456/n7218/abs/nature07485.html

Timothy J. Ley, Elaine R. Mardis, Li Ding, Bob Fulton,
Michael D. McLellan, Ken Chen, David Dooling,
Brian H. Dunford-Shore, Sean McGrath, Matthew Hickenbotham,
Lisa Cook, Rachel Abbott, David E. Larson, Dan C. Koboldt,
Craig Pohl, Scott Smith, Amy Hawkins, Scott Abbott,
Devin Locke, LaDeana W. Hillier, Tracie Miner,
Lucinda Fulton, Vincent Magrini, Todd Wylie,
Jarret Glasscock, Joshua Conyers, Nathan Sander, Xiaoqi Shi,
John R. Osborne, Patrick Minx, David Gordon, Asif Chinwalla,
Yu Zhao, Rhonda E. Ries, Jacqueline E. Payton,
Peter Westervelt, Michael H. Tomasson, Mark Watson,
Jack Baty, Jennifer Ivanovich, Sharon Heath,
William D. Shannon, Rakesh Nagarajan, Matthew J. Walter,
Daniel C. Link, Timothy A. Graubert, John F. DiPersio &
Richard K. Wilson
Nature 456, 66-72 (6 November 2008)
doi: 10.1038/nature07485