Only Perception: 絲盤蟲基因組完成定序理解動物起源

2008-09-04

絲盤蟲基因組完成定序理解動物起源

Trichoplax genome sequenced -- 'rosetta stone' for understanding evolution
http://www.physorg.com/news139677311.html

September 03, 2008

(PhysOrg.com) -- 耶魯分子與演化生物學家同美國能源部科學家的合作下，產生了絲盤蟲（Trichoplax）的完整基因組序列，那是自然界最原始的多細胞生物之一，對於所有更高等動物的演化提供了一種新洞見。

這項發表在 Nature 期刊線上版的研究證明，雖然 Trichoplax 是擁有最小核基因組（nuclear genomes，譯註：指細胞核的基因組，粒線體也有基因組）的其中一種多細胞生物，但其所包含用以基因調控的特徵序列可在更複雜的動物與人類身上找到。此外，它將 Trichoplax 界定為動物演化的一個分歧點。

"Trichoplax placozoans 只有四種體細胞類型且沒有結構化器官的動物。它們代表最老多細胞動物的後代，也許比海綿還要更老，" 作者 Stephen Dellaporta 說，耶魯分子、細胞與發展生物學教授。

這項研究證明，與人類的核基因組相較（那包含 30 億個鹼基對），Trichoplax 只有 9800 萬個。較早期的定序研究證明，Trichoplax 的粒線體基因組比那些可在絕大多數的動物身上所找到的基因、內含子以及間隔序列要大二倍以上，如同最原始的生物。

然而，大小並非全部。生物所共同分享的 DNA 序列代表著他們在分歧時有什麼東西在其基因組中。不同於其他用以研究演化的模型系統，包括果蠅與蠕蟲，Trichoplax 與人類基因組之間的基因排列甚至都被保留下來。

"Trichoplax 有 80% 的基因組與人類相同，" Dellaporta 說。"我們很興奮的發現，Trichoplax 包含共有的路徑與界定分明的調控序列，那連接了這些最原始的祖先與更高等的動物物種。Trichoplax 基因組將成為某一類用來理解動物物種起源路徑的羅塞塔石（Rosetta Stone）。"

※ 相關報導：

＊ Genome sequence deepens mystery of inconspicuous sea creature
http://www.physorg.com/news138981858.html

＊ The Trichoplax genome and the nature of placozoans
http://www.nature.com/nature/journal/v454/n7207/abs/nature07191.html

Mansi Srivastava, Emina Begovic, Jarrod Chapman,
Nicholas H. Putnam, Uffe Hellsten, Takeshi Kawashima,
Alan Kuo, Therese Mitros, Asaf Salamov,
Meredith L. Carpenter, Ana Y. Signorovitch, Maria A. Moreno,
Kai Kamm, Jane Grimwood, Jeremy Schmutz, Harris Shapiro,
Igor V. Grigoriev, Leo W. Buss, Bernd Schierwater,
Stephen L. Dellaporta & Daniel S. Rokhsar
Nature 454, 955-960 (21 August 2008)
doi: 10.1038/nature07191