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August 27, 2008
(PhysOrg.com) -- Iowa 州立大學研究者 Robert Jernigan 相信，他的研究證明蛋白質具有受控制的運動。傳統上，大部分的生物化學家相信蛋白質具有許多隨機的、不受控制的運動。
由 Jernigan，L.H. Baker 生物資訊與生物統計學中心主任，連同 Guang Song，電腦科學系助理教授以及畢業生 Lei Yang 所進行的研究，在十年期間中證明，不僅是蛋白質運動受到更多限制，這些受到限制、受到控制的運動也是蛋白質功能的一部份。
該小組的發現最近發表在「Structure」期刊中。
把來自於 HIV 病毒的蛋白質當成例子來使用，Jernigan 利用一種簡單的模型與試驗來進行他的研究，要看看蛋白質如何移動。大量報告過的結構確切證明這些運動為其功能所需，而且與 Jernigan 的模型所計算的運動完全一樣。
"這是一個具指標性的（indicative）實驗例子，但這裡還有許多其他的，" 他說。
Jernigan 相信這是更加了解蛋白質與細胞行為的第一步。
"有了這種新發現的資訊，這裡有創造出設計師藥物（designer drug）的可能性，" 他說。
"這些是符合「結構已被設計成對其運動施加非常強大的控制」這種觀點的模型，" 他說。"這些運動與其功能所需的運動密切相符。"
例如，Jernigan 所研究的 HIV 病毒蛋白結構並不會隨機運動，而是實際上的開與闔以允許存取其他結構。
這裡有一個結合地點，那必須開啟以允許進入這個蛋白，並接著再度關閉，讓此蛋白能夠作用，他說。
因為蛋白結構的開啟與關閉身為其功能的一部份，Jernigan 相信這些運動受到控制，而且是蛋白質的部份功能。
Jernigan 研究使用 HIV 病毒，但他相信這些結果與許多其他蛋白質結構有關。
※ 相關報導：
＊ Close Correspondence between the Motions from Principal Component Analysis of Multiple HIV-1 Protease Structures and Elastic Network Modes
http://www.structure.org/content/article/abstract?uid=PIIS0969212608000117
Lei Yang, Guang Song, Alicia Carriquiry, and＊ 變形蛋白：改變對蛋白質結構存在已久的概念
Robert L. Jernigan
Structure, Vol 16, 321-330, 12 February 2008
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